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通過高企認定的企業(yè)一定要注意，三年期滿一定要做好高企復(fù)審工作。一旦高企復(fù)審沒有通過，將為企業(yè)帶來嚴重的后果，讓企業(yè)損失慘重。
 一、失去享受高企稅收優(yōu)惠政策的資格，且要補繳失效當年全年稅款
國家稅務(wù)總局2017年發(fā)布的關(guān)于《國家稅務(wù)總局關(guān)于實施高新技術(shù)企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策有關(guān)問題的公告》，明確了高新技術(shù)企業(yè)享受所得稅優(yōu)惠政策的起止時間。
在獲得高新技術(shù)企業(yè)證書當年1月1日起可享受所得稅優(yōu)惠政策，在高新技術(shù)企業(yè)證書到期當年未復(fù)審?fù)ㄟ^重新取得的證書的企業(yè)，證書失效當年將不再享受所得稅優(yōu)惠政策，應(yīng)按25%的稅率補繳少繳的稅款。
未通過高企重新認定首先面臨的是需要補繳高企證書失效當年全年的稅款，因為證書失效當年不再享受所得稅15%稅率優(yōu)惠。
例如：某企業(yè)的高企證書2020年8月15日到期，在2020年可按照15%的稅率預(yù)繳企業(yè)企業(yè)所得稅稅款;若2020年底未能通過高企復(fù)審的話，將在2021年匯算清繳時按25%的稅率補繳2020年全年少繳的企業(yè)所得稅稅款。
 二、不能申請企業(yè)研發(fā)資助款項
根據(jù)2020年企業(yè)研究開發(fā)資助申請指南的申報條件，申報研發(fā)資助的企業(yè)需為國家高新技術(shù)企業(yè)、市高新技術(shù)企業(yè)或規(guī)模以上工業(yè)企業(yè)和服務(wù)業(yè)。除了市級的研發(fā)資助需要高企資質(zhì)外，各區(qū)級研發(fā)資助申報條件也需要企業(yè)獲得高企資質(zhì)才能申請。一旦企業(yè)失去高企資格，也就不再能申請企業(yè)研發(fā)資助款項了。
 三、其他影響
1、據(jù)調(diào)查高新技術(shù)企業(yè)資質(zhì)具有較高的社會影響力，許多重大項目的招投標都要求企業(yè)具備高新資質(zhì)。一旦不能通過復(fù)審或未參加復(fù)審，企業(yè)在運營決策必將受到影響。
2、高新認定管理辦法雖沒有禁止未通過或未參加高企復(fù)審的企業(yè)再次申報高企，但是由于未能滿足復(fù)審條件(近三年資料不符合高企要求)，再次申報的需等待較長時間。這不僅增加了工作的難度，還會存在政策變化的風(fēng)險。